PhD position: Partitioning of Prokaryotic Functional Diversity under Different Land Use (ProFunD), Uni Bremen

Fachgebiete: Biologie Chemie Geowissenschaften
Thema: Doktorarbeit: Partitioning of Prokaryotic Functional Diversity under Different Land Use (ProFunD)
Ansprechpartner: Prof. Michael Friedrich
Antwort an: michael.friedrich@uni-bremen.de
Institution: Mikrobielle Ökophysiologie
Ort: 28359 Bremen, Leobener Straße 3

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In unserem Projekt werden die Funktionen dominanter Bakterien (Acidobacteria, Actinobacteria, Proteobacteria) im Boden untersucht. Dies umfasst 16S rRNA-basierte Analysen mit der Illumina HiSeq-Technologie, Sequenzanalyse mit Linux-basierten Pipelines, multivariate statistische Analysen von Umweltparametern der bakteriellen Verteilungsmuster, physiologische Untersuchungen anhand von 13C-Pulsmarkierungs-Versuchen, RNA-based Stable Isotope Probing (RNA-SIP), sowie modernste molekularbiologische und physiologische Feldarbeiten in den Biodiversitäts-Exploratorien der Deutschen Forschungsgemeinschaft (SPP 1374; http://www.biodiversity-exploratories.de). In den Biodiversitäts-Exploratorien arbeiten ökologisch, bodenmikro¬biologisch, metagenomisch und agrar-/forst¬wissen¬schaftlich ausgerichtete Arbeitsgruppen interdisziplinär eng zusammen. Innerhalb des SPP 1374 werden zahlreiche Workshops (u.a. Multivariate Statistik) angeboten. Es besteht Gelegenheit zur Teilnahme an Promotionsp!
rogrammen
(marmic) inklusive der Betreuung durch ein PhD committee sowie zur Nutzung der Angebote des Promotionszentrums (ProUB) der Exzellenz-Universität Bremen.

Methoden:
molecular ecology, 16S rRNA sequencing, Illumina sequencing, stable isotope probing of RNA, qPCR, multivariate statistics

Anfangsdatum: 1. April 2017

geschätzte Dauer: 36 Monate

Bezahlung: TvL 13 (65%)

Homepage: http://www.ag-friedrich.uni-bremen.de/en/ag-friedrich